Back to Multiple platform build/check report for BioC 3.9
ABCDEFGHIJKLM[N]OPQRSTUVWXYZ

INSTALL report for NGScopy on malbec2

This page was generated on 2019-04-09 11:39:41 -0400 (Tue, 09 Apr 2019).

Package 1083/1703HostnameOS / ArchINSTALLBUILDCHECKBUILD BIN
NGScopy 1.17.2
Xiaobei Zhao
Snapshot Date: 2019-04-08 17:01:18 -0400 (Mon, 08 Apr 2019)
URL: https://git.bioconductor.org/packages/NGScopy
Branch: master
Last Commit: a2cfc87
Last Changed Date: 2019-04-08 08:08:29 -0400 (Mon, 08 Apr 2019)
malbec2 Linux (Ubuntu 18.04.2 LTS) / x86_64 [ ERROR ] ERROR  skipped 
tokay2 Windows Server 2012 R2 Standard / x64  ERROR  ERROR  skipped  skipped 
celaya2 OS X 10.11.6 El Capitan / x86_64  ERROR  ERROR  skipped  skipped 
merida2 OS X 10.11.6 El Capitan / x86_64  ERROR  ERROR  skipped  skipped 

Summary

Package: NGScopy
Version: 1.17.2
Command: /home/biocbuild/bbs-3.9-bioc/R/bin/R CMD INSTALL NGScopy
StartedAt: 2019-04-08 19:03:10 -0400 (Mon, 08 Apr 2019)
EndedAt: 2019-04-08 19:03:10 -0400 (Mon, 08 Apr 2019)
EllapsedTime: 0.5 seconds
RetCode: 1
Status:  ERROR 

Command output

##############################################################################
##############################################################################
###
### Running command:
###
###   /home/biocbuild/bbs-3.9-bioc/R/bin/R CMD INSTALL NGScopy
###
##############################################################################
##############################################################################


* installing to library ‘/home/biocbuild/bbs-3.9-bioc/R/library’
ERROR: dependency ‘rbamtools’ is not available for package ‘NGScopy’
* removing ‘/home/biocbuild/bbs-3.9-bioc/R/library/NGScopy’