##############################################################################
##############################################################################
###
### Running command:
###
### /home/biocbuild/bbs-3.3-bioc/R/bin/R CMD INSTALL DESeq
###
##############################################################################
##############################################################################
* installing to library ‘/home/biocbuild/bbs-3.3-bioc/R/library’
* installing *source* package ‘DESeq’ ...
** libs
gcc -std=gnu99 -I/home/biocbuild/bbs-3.3-bioc/R/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -fpic -g -O2 -Wall -c pval.c -o pval.o
pval.c: In function ‘add_from_both_sides’:
pval.c:26:11: warning: unused variable ‘esttotalperlength’ [-Wunused-variable]
double esttotalperlength = total/2;
^
gcc -std=gnu99 -shared -L/home/biocbuild/bbs-3.3-bioc/R/lib -L/usr/local/lib -o DESeq.so pval.o -L/home/biocbuild/bbs-3.3-bioc/R/lib -lR
installing to /home/biocbuild/bbs-3.3-bioc/R/library/DESeq/libs
** R
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
* DONE (DESeq)