############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data singleCellTK ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘singleCellTK/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘singleCellTK’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes ----------------------------------- ERROR: dependencies ‘batchelor’, ‘DESeq2’, ‘GSVAdata’, ‘scater’, ‘scMerge’, ‘scran’, ‘sva’, ‘enrichR’, ‘celda’, ‘DropletUtils’, ‘zinbwave’, ‘scDblFinder’, ‘scuttle’ are not available for package ‘singleCellTK’ Perhaps try a variation of: install.packages(c('batchelor', 'DESeq2', 'GSVAdata', 'scater', 'scMerge', 'scran', 'sva', 'enrichR', 'celda', 'DropletUtils', 'zinbwave', 'scDblFinder', 'scuttle')) * removing ‘/private/tmp/RtmpWTSHdk/Rinstee485cb7f83f/singleCellTK’ ----------------------------------- ERROR: package installation failed