############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data gsean ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘gsean/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘gsean’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to process help pages * saving partial Rd database * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘gsean.Rmd’ using rmarkdown Warning: program compiled against libxml 212 using older 211 Quitting from lines 92-132 [unnamed-chunk-2] (gsean.Rmd) Error: processing vignette 'gsean.Rmd' failed with diagnostics: there is no package called 'pasilla' --- failed re-building ‘gsean.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘gsean.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted