############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/hpages/bbs-3.18-bioc-R41/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data flowCore ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘flowCore/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘flowCore’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * cleaning src * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘HowTo-flowCore.Rnw’ using knitr Quitting from lines 1196-1197 [plotALL-openCyto] (HowTo-flowCore.Rnw) Error: processing vignette 'HowTo-flowCore.Rnw' failed with diagnostics: argument to 'which' is not logical --- failed re-building ‘HowTo-flowCore.Rnw’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘HowTo-flowCore.Rnw’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted