############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R-4.3.1/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data LowMACA ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘LowMACA/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘LowMACA’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘LowMACA.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 148-149 [fourthchunk] (LowMACA.Rmd) Error: processing vignette 'LowMACA.Rmd' failed with diagnostics: Clustal Omega command not found. clustalo is not in your PATH or it was not installed --- failed re-building ‘LowMACA.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘LowMACA.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted