### R code from vignette source 'vignettes/ChIPseeker/inst/doc/ChIPseeker.Rnw' ################################################### ### code chunk number 1: ChIPseeker.Rnw:67-84 ################################################### library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene) library(clusterProfiler) library(ChIPseeker) library(org.Hs.eg.db) library(GenomicFeatures) library(GenomicRanges) library(knitr) opts_chunk$set(tidy_source=TRUE, tidy.opts=list(blank=FALSE, width.cutoff=50), out.truncate=80, out.lines=6, cache=TRUE, dev='pdf', include=TRUE, fig.width=6, fig.height=6, resolution=100)